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Stan
1.3
probability, sampling & optimization
|
#include <boost/random/normal_distribution.hpp>#include <boost/random/variate_generator.hpp>#include <stan/math/matrix_error_handling.hpp>#include <stan/math/error_handling.hpp>#include <stan/prob/constants.hpp>#include <stan/prob/traits.hpp>#include <stan/agrad/agrad.hpp>#include <stan/meta/traits.hpp>#include <stan/agrad/matrix.hpp>#include <stan/math/matrix/columns_dot_product.hpp>#include <stan/math/matrix/columns_dot_self.hpp>#include <stan/math/matrix/dot_product.hpp>#include <stan/math/matrix/dot_self.hpp>#include <stan/math/matrix/log.hpp>#include <stan/math/matrix/log_determinant.hpp>#include <stan/math/matrix/mdivide_left_tri_low.hpp>#include <stan/math/matrix/mdivide_left_spd.hpp>#include <stan/math/matrix/multiply.hpp>#include <stan/math/matrix/subtract.hpp>#include <stan/math/matrix/sum.hpp>Go to the source code of this file.
Namespaces | |
| namespace | stan |
| Probability, optimization and sampling library. | |
| namespace | stan::prob |
| Templated probability distributions. | |
Functions | |
| template<bool propto, typename T_y , typename T_loc , typename T_covar , class Policy > | |
| boost::math::tools::promote_args < T_y, T_loc, T_covar >::type | stan::prob::multi_normal_cholesky_log (const Eigen::Matrix< T_y, Eigen::Dynamic, 1 > &y, const Eigen::Matrix< T_loc, Eigen::Dynamic, 1 > &mu, const Eigen::Matrix< T_covar, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &L, const Policy &) |
| The log of the multivariate normal density for the given y, mu, and a Cholesky factor L of the variance matrix. | |
| template<bool propto, typename T_y , typename T_loc , typename T_covar > | |
| boost::math::tools::promote_args < T_y, T_loc, T_covar >::type | stan::prob::multi_normal_cholesky_log (const Eigen::Matrix< T_y, Eigen::Dynamic, 1 > &y, const Eigen::Matrix< T_loc, Eigen::Dynamic, 1 > &mu, const Eigen::Matrix< T_covar, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &L) |
| template<typename T_y , typename T_loc , typename T_covar , class Policy > | |
| boost::math::tools::promote_args < T_y, T_loc, T_covar >::type | stan::prob::multi_normal_cholesky_log (const Eigen::Matrix< T_y, Eigen::Dynamic, 1 > &y, const Eigen::Matrix< T_loc, Eigen::Dynamic, 1 > &mu, const Eigen::Matrix< T_covar, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &L, const Policy &) |
| template<typename T_y , typename T_loc , typename T_covar > | |
| boost::math::tools::promote_args < T_y, T_loc, T_covar >::type | stan::prob::multi_normal_cholesky_log (const Eigen::Matrix< T_y, Eigen::Dynamic, 1 > &y, const Eigen::Matrix< T_loc, Eigen::Dynamic, 1 > &mu, const Eigen::Matrix< T_covar, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &L) |
| template<bool propto, typename T_y , typename T_loc , typename T_covar , class Policy > | |
| boost::math::tools::promote_args < T_y, T_loc, T_covar >::type | stan::prob::multi_normal_cholesky_log (const Eigen::Matrix< T_y, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &y, const Eigen::Matrix< T_loc, Eigen::Dynamic, 1 > &mu, const Eigen::Matrix< T_covar, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &L, const Policy &) |
| y can have multiple rows (observations) and columns (on variables) | |
| template<bool propto, typename T_y , typename T_loc , typename T_covar > | |
| boost::math::tools::promote_args < T_y, T_loc, T_covar >::type | stan::prob::multi_normal_cholesky_log (const Eigen::Matrix< T_y, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &y, const Eigen::Matrix< T_loc, Eigen::Dynamic, 1 > &mu, const Eigen::Matrix< T_covar, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &L) |
| template<typename T_y , typename T_loc , typename T_covar , class Policy > | |
| boost::math::tools::promote_args < T_y, T_loc, T_covar >::type | stan::prob::multi_normal_cholesky_log (const Eigen::Matrix< T_y, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &y, const Eigen::Matrix< T_loc, Eigen::Dynamic, 1 > &mu, const Eigen::Matrix< T_covar, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &L, const Policy &) |
| template<typename T_y , typename T_loc , typename T_covar > | |
| boost::math::tools::promote_args < T_y, T_loc, T_covar >::type | stan::prob::multi_normal_cholesky_log (const Eigen::Matrix< T_y, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &y, const Eigen::Matrix< T_loc, Eigen::Dynamic, 1 > &mu, const Eigen::Matrix< T_covar, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &L) |
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| boost::math::tools::promote_args < T_y, T_loc, T_covar >::type | stan::prob::multi_normal_log (const Eigen::Matrix< T_y, Eigen::Dynamic, 1 > &y, const Eigen::Matrix< T_loc, Eigen::Dynamic, 1 > &mu, const Eigen::Matrix< T_covar, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &Sigma, const Policy &) |
| The log of the multivariate normal density for the given y, mu, and variance matrix. | |
| template<bool propto, typename T_y , typename T_loc , typename T_covar > | |
| boost::math::tools::promote_args < T_y, T_loc, T_covar >::type | stan::prob::multi_normal_log (const Eigen::Matrix< T_y, Eigen::Dynamic, 1 > &y, const Eigen::Matrix< T_loc, Eigen::Dynamic, 1 > &mu, const Eigen::Matrix< T_covar, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &Sigma) |
| template<typename T_y , typename T_loc , typename T_covar , class Policy > | |
| boost::math::tools::promote_args < T_y, T_loc, T_covar >::type | stan::prob::multi_normal_log (const Eigen::Matrix< T_y, Eigen::Dynamic, 1 > &y, const Eigen::Matrix< T_loc, Eigen::Dynamic, 1 > &mu, const Eigen::Matrix< T_covar, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &Sigma, const Policy &) |
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| boost::math::tools::promote_args < T_y, T_loc, T_covar >::type | stan::prob::multi_normal_log (const Eigen::Matrix< T_y, Eigen::Dynamic, 1 > &y, const Eigen::Matrix< T_loc, Eigen::Dynamic, 1 > &mu, const Eigen::Matrix< T_covar, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &Sigma) |
| template<bool propto, typename T_y , typename T_loc , typename T_covar , class Policy > | |
| boost::math::tools::promote_args < T_y, T_loc, T_covar >::type | stan::prob::multi_normal_log (const Eigen::Matrix< T_y, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &y, const Eigen::Matrix< T_loc, Eigen::Dynamic, 1 > &mu, const Eigen::Matrix< T_covar, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &Sigma, const Policy &) |
| y can have multiple rows (observations) and columns (on variables) | |
| template<bool propto, typename T_y , typename T_loc , typename T_covar > | |
| boost::math::tools::promote_args < T_y, T_loc, T_covar >::type | stan::prob::multi_normal_log (const Eigen::Matrix< T_y, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &y, const Eigen::Matrix< T_loc, Eigen::Dynamic, 1 > &mu, const Eigen::Matrix< T_covar, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &Sigma) |
| template<typename T_y , typename T_loc , typename T_covar , class Policy > | |
| boost::math::tools::promote_args < T_y, T_loc, T_covar >::type | stan::prob::multi_normal_log (const Eigen::Matrix< T_y, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &y, const Eigen::Matrix< T_loc, Eigen::Dynamic, 1 > &mu, const Eigen::Matrix< T_covar, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &Sigma, const Policy &) |
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| boost::math::tools::promote_args < T_y, T_loc, T_covar >::type | stan::prob::multi_normal_log (const Eigen::Matrix< T_y, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &y, const Eigen::Matrix< T_loc, Eigen::Dynamic, 1 > &mu, const Eigen::Matrix< T_covar, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &Sigma) |
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| template<typename T_y , typename T_loc , typename T_covar , class Policy > | |
| boost::math::tools::promote_args < T_y, T_loc, T_covar >::type | stan::prob::multi_normal_prec_log (const Eigen::Matrix< T_y, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &y, const Eigen::Matrix< T_loc, Eigen::Dynamic, 1 > &mu, const Eigen::Matrix< T_covar, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &Sigma, const Policy &) |
| template<typename T_y , typename T_loc , typename T_covar > | |
| boost::math::tools::promote_args < T_y, T_loc, T_covar >::type | stan::prob::multi_normal_prec_log (const Eigen::Matrix< T_y, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &y, const Eigen::Matrix< T_loc, Eigen::Dynamic, 1 > &mu, const Eigen::Matrix< T_covar, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &Sigma) |
| template<class RNG > | |
| Eigen::VectorXd | stan::prob::multi_normal_rng (const Eigen::Matrix< double, Eigen::Dynamic, 1 > &mu, const Eigen::Matrix< double, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &S, RNG &rng) |